PROFILE Entry: PS50524

<TITLE>PROFILE Entry: PS50524 </TITLE><pre>ID   RDRP_MONONEGAVIRALES; MATRIX.
AC   <A HREF="http://www.expasy.ch/cgi-bin/get-prosite-entry?PS50524">PS50524</A>;
DT   JUL-2002 (CREATED); JUL-2002 (DATA UPDATE); JUL-2002 (INFO UPDATE).
DE   Profile for RNA-directed RNA polymerase of Mononegavirales.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=131;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=126;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2467; R2=0.01956620; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1418; N_SCORE=30.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=396; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-9;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-17,-15,-16,-10,-22,-20,10,-13,0,1,-15,-22,-16,-10,-4,-2,20,-28,-11,-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,-5,-8,-7,-20,-4,-2,-22,-7,-22,-13,1,-15,-5,-7,13,8,-13,-31,-14,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-19,12,-25,-21,4,-23,-15,-3,-20,-3,-3,-16,-26,-19,-20,-7,-4,1,-17,6,-21;
MA   /M: SY='F'; M=6,-13,-13,-19,-15,12,-13,-17,-5,-17,-9,-8,-6,-19,-18,-16,8,4,3,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-20,-25,-28,-20,10,-30,-19,19,-17,13,11,-12,-22,-17,-16,-18,-9,9,-16,2,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,2,-17,-6,-9,-13,-16,5,-7,-11,-13,-7,10,-17,-7,-9,8,13,-3,-33,-8,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-16,-21,-16,-2,-25,-20,9,-19,14,7,-13,-18,-14,-16,-3,19,8,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-27,-24,-30,-22,22,-31,-10,16,-25,29,12,-25,-29,-19,-19,-25,-10,6,-3,25,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-21,5,17,-24,-13,-6,-21,9,-24,-15,7,-9,7,2,11,2,-16,-31,-17,12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-28,0,9,-29,-18,-9,-29,43,-30,-11,1,-10,10,25,-5,-7,-19,-22,-11,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-35,-33,-26,36,-26,-9,-8,-19,-5,-8,-28,-30,-22,-16,-28,-18,-15,70,48,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,9,52,-6,-15,-20,-15,-10,-25,-15,-25,-20,19,-30,-15,-15,0,-5,-20,-45,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-1,-21,-7,-4,-12,-18,-5,-4,-10,5,1,5,-19,4,-7,-6,0,-11,-27,-9,0;
MA   /M: SY='N'; M=5,8,-21,0,-2,-23,1,13,-22,-6,-23,-12,17,-15,5,-6,8,-4,-21,-30,-13,1;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-23,-32,-27,-15,17,-23,-12,-9,-13,-6,1,-20,-23,-1,-10,-20,-16,-16,39,15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-30,-12,-2,4,-26,5,-9,-3,-6,-4,-14,-10,1,-5,-14,-10,-15,2,31,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-27,6,35,-15,-20,-3,-23,3,-14,-13,-3,-8,14,1,-2,-8,-23,-24,-12,25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-13,-9,-9,-3,-14,-14,-9,-13,-10,-10,5,-16,-10,-11,15,22,-5,-29,-9,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-10,-10,-9,-15,-17,-12,-4,-11,-12,-5,5,-15,-2,-11,11,15,-4,-31,-12,-6;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-9,-11,-2,-21,-3,-15,-15,-8,-14,-11,-4,-14,-5,-11,3,-4,-10,-27,-19,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-14,-28,-13,-10,-17,-12,-14,-5,-16,-6,-5,-14,13,-13,-19,-10,-10,-9,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-3,-36,-29,34,-31,-25,12,-28,10,4,-23,-30,-32,-23,-17,-8,16,-12,8,-29;
MA   /M: SY='F'; M=4,-20,-4,-28,-21,17,-13,-21,-4,-23,-1,-5,-14,-23,-24,-21,-6,-6,-1,-14,-2,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,9,-28,15,15,-30,-15,3,-29,13,-24,-14,6,-12,18,18,1,-7,-24,-28,-13,15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-14,-12,-10,-11,-19,-8,-4,-5,-11,-5,-3,-21,-4,1,1,3,2,-24,-4,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,4,-31,-22,2,-28,-21,9,-27,28,13,-27,-30,-20,-21,-24,-11,4,-16,-4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,38,-25,41,8,-31,1,1,-32,-2,-30,-25,32,-14,-2,-7,6,-6,-29,-38,-21,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-30,6,31,-32,-20,5,-26,15,-21,-10,0,-8,32,16,-2,-10,-27,-24,-13,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-7,-33,-25,8,-30,-20,21,-26,24,21,-24,-27,-20,-21,-21,-9,15,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-24,-27,-21,34,-28,6,2,-21,13,9,-19,-28,-19,-14,-21,-11,-3,2,34,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-7,-18,-29,63,-17,-38,-18,-30,-20,6,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-4,-27,-23,11,-29,-18,8,-22,15,5,-22,-28,-22,-18,-14,2,12,-18,6,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-6,-33,-2,2,-26,-8,-11,-26,7,-26,-15,-5,20,2,3,-7,-11,-26,-24,-18,0;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-1,-22,-3,-2,-17,-4,8,-21,-4,-23,-13,7,-11,1,-1,10,2,-18,-25,-5,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-19,-33,-24,28,-30,-21,16,-29,33,13,-27,-30,-27,-20,-24,-9,13,-13,7,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-39,-29,66,-31,-19,7,-29,11,3,-20,-29,-36,-21,-20,-10,4,7,29,-29;
MA   /M: SY='S'; M=-5,9,-15,8,13,-23,-10,-3,-24,1,-25,-18,13,-12,7,2,14,4,-20,-34,-18,9;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-24,-38,-25,-16,-4,-20,-17,-23,1,-19,-15,-20,-24,-7,17,-22,-14,-23,64,10,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,-19,-24,-20,-4,-16,-19,12,-19,12,14,-16,-21,-15,-17,-8,3,11,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-2,-15,-3,-3,-20,-21,87,-30,-12,-20,-2,7,-22,6,-3,-10,-19,-28,-32,15,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-25,-6,11,-10,-22,-9,-12,-4,-2,-6,-10,-6,1,-5,-6,-2,-13,-22,-7,5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-23,-27,-18,9,-28,-18,8,-12,9,5,-14,-22,-15,1,-14,-2,6,-17,1,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-23,-34,-24,31,-31,-22,14,-28,19,8,-23,-16,-27,-22,-22,-10,7,-10,8,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-15,-1,20,-25,-21,-7,-21,2,-18,-9,-8,7,8,-2,-5,-9,-21,-29,-19,13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-3,1,-12,-17,-6,-22,15,-16,-8,-2,-15,3,13,-7,-7,-16,-19,-6,2;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,14,-11,-10,-16,-13,-18,-16,-14,-19,-15,-1,-17,-10,-15,21,21,-4,-38,-18,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-18,-23,-23,-19,3,-25,-17,-1,-16,-2,-4,-17,-21,-15,-15,-7,12,-1,17,13,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-24,-36,-26,11,-33,-21,32,-26,26,24,-23,-24,-19,-23,-22,-10,19,-17,3,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-27,-24,-22,16,-31,10,11,-16,4,6,-18,-27,-14,-15,-18,-10,4,5,44,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-18,-5,-18,-22,-2,-29,-17,12,-19,4,2,-20,-27,-21,-20,-13,-6,18,-21,4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-1,-13,-6,-8,-24,16,-12,-25,-11,-24,-16,6,-16,-4,-12,13,3,-18,-29,-22,-6;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-26,38,8,-27,-3,-1,-31,-5,-26,-23,11,-13,-3,-11,5,-5,-23,-29,-9,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-29,-12,-6,-16,-9,-10,-21,1,-19,-12,-9,12,-5,11,-7,-9,-19,-19,-11,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-23,-12,-8,10,-19,13,-13,-13,-12,-7,-4,-10,-9,-10,-2,-3,-14,-12,16,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=-6,19,2,17,-2,-23,-11,-4,-26,-6,-24,-20,17,-20,-6,-7,2,-5,-21,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-35,-9,-3,-23,-21,-19,-13,-12,-17,-13,-19,58,-11,-17,-12,-9,-20,-29,-24,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-34,-15,-6,-22,-22,-19,-9,-13,-16,-9,-20,59,-11,-20,-11,-9,-17,-28,-23,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-23,7,-3,-13,-11,6,-19,-7,-17,-13,4,-16,-5,-7,1,-1,-15,-22,2,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-7,-18,-8,-11,-11,-22,-17,4,-18,5,-1,-7,-14,-13,-18,-8,-3,1,-29,-11,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-25,-4,-7,-16,-10,-10,-14,-3,-12,-9,-5,-13,-8,1,-5,-6,-8,-23,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-22,4,2,-21,-7,-2,-21,0,-21,-12,11,-8,-1,1,6,6,-18,-31,-15,0;
MA   /M: SY='H'; M=-13,2,-26,2,-4,-10,-6,17,-19,-13,-12,-8,5,-20,-6,-10,-8,-13,-19,-24,-2,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-8,-20,-10,0,-9,-24,-13,-6,-4,-8,-5,-8,-15,-1,-6,-4,2,-6,-17,-4,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-8,4,-26,6,-1,-21,-12,-10,-14,-8,-12,-11,3,-2,-5,-9,-4,-6,-14,-30,-17,-4;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-15,-16,-15,-14,-4,-25,-13,6,-12,11,4,-13,-22,-11,-3,-16,-8,4,-20,-2,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-10,11,3,-14,-13,-1,-15,-6,-9,-10,6,-15,0,-7,-3,-6,-15,-22,-4,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='B'; M=-8,11,-18,11,5,-15,-10,0,-13,2,-12,-8,9,-10,4,1,-1,-3,-14,-19,-6,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-12,-16,-14,-11,-10,-17,6,0,-12,-6,2,-8,-10,-8,-11,0,1,4,-25,-5,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-24,-5,-1,-20,-19,-17,-9,-10,-13,-11,-11,17,-9,-16,0,2,-7,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,21,-29,24,16,-25,-11,-1,-28,2,-26,-21,16,-13,5,-4,-1,-9,-29,-13,-13,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,3,-19,3,-3,-29,17,-4,-29,-9,-25,-16,6,-16,1,-11,7,-7,-23,-28,-20,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-26,12,2,-27,-7,-10,-22,-4,-24,-17,2,7,-3,-7,2,-5,-18,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-23,-21,-21,-8,-4,-23,3,-20,-6,-3,-9,-20,-18,-19,-3,1,5,-15,-10,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-21,28,-28,-23,10,-24,-20,-8,-24,-2,-6,-18,-29,-25,-22,-8,-5,0,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-27,-31,-32,-24,15,-27,-16,7,-18,0,-1,-23,-25,-18,-16,-21,-13,-1,32,25,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-22,-9,-7,-15,-19,5,-8,-1,-14,-4,3,-19,-2,7,0,-2,-4,-29,-7,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-26,-5,-14,-14,28,-8,-27,-14,-23,-16,3,-20,-13,-15,2,-10,-22,-16,-5,-14;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-3,-28,0,2,-23,-19,13,-18,-8,-13,-7,-5,10,6,-8,-6,-6,-21,-27,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-26,-5,1,-18,-15,-5,-14,13,-8,9,-6,-15,3,12,-12,-11,-12,-22,-9,2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-26,-10,-17,-27,53,-19,-34,-18,-27,-18,0,-18,-17,-18,5,-10,-24,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-12,-20,-27,61,-18,-34,-19,-25,-12,-2,-20,-18,-19,-2,-19,-26,-20,-27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-28,-31,-23,-5,-25,-25,27,-20,14,12,-18,-21,-17,-21,-18,-11,16,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-25,-31,-22,14,-28,-14,14,-24,29,16,-28,-28,-17,-18,-28,-12,3,7,16,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-14,45,-19,-13,-22,-24,-14,-29,-3,-20,-14,-10,-29,-5,12,-7,-9,-16,-35,-20,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,11,-20,0,0,-10,59,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-30,-2,6,-23,-21,-6,-26,43,-26,-9,-2,-12,8,25,-11,-10,-19,-14,1,6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-20,-25,-20,-2,-5,-20,5,-23,19,9,-20,-25,-19,-19,-16,-8,5,-21,-9,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-20,-34,-25,0,-33,-23,33,-26,20,22,-20,-22,-16,-24,-17,-8,20,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-4,-24,-14,-7,-28,-21,13,-20,8,7,-17,-21,-15,-20,-10,-3,12,-28,-10,-16;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-12,-7,-7,-13,-10,-14,-11,-12,-12,-11,4,-13,-7,-11,19,21,-5,-32,-15,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-8,-31,-24,-1,-31,-25,24,-27,18,11,-21,-25,-20,-24,-15,-6,18,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='C'; M=4,-16,12,-19,-14,-12,-17,-20,-9,-20,-2,-7,-14,-13,-15,-19,0,0,-4,-32,-17,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-24,-13,-11,-7,-20,-11,-5,-8,-2,1,-15,-21,-5,-3,-12,-8,-3,-2,1,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-26,-31,-19,-1,-35,-25,33,-25,21,15,-21,-21,-17,-24,-19,-9,22,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-26,3,4,-15,-21,1,-9,-9,-8,-6,-3,-15,3,-10,-4,-6,-11,-23,-3,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-23,-14,-3,-25,-15,5,-10,18,7,-17,-24,-10,6,-16,-7,4,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='A'; M=12,-14,-15,-16,-6,-12,-17,-19,4,-12,-2,-3,-14,-16,-11,-16,1,-1,12,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-14,-14,-3,-15,-8,-15,-8,-12,-3,-5,-9,-13,-6,-15,7,1,-3,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-14,-22,-17,-9,-8,-22,-8,-3,-2,-4,0,-11,-19,-1,3,-8,-5,-1,-18,-1,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-28,-2,14,-22,-23,-4,-16,17,-16,-8,-3,-11,6,13,-7,-7,-13,-24,-10,9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-20,-12,-11,-12,-12,-7,-9,-7,-12,-7,-1,-17,-7,0,6,10,-4,-25,-6,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-25,3,-3,-25,11,-1,-27,2,-28,-16,21,-11,-1,0,3,-8,-26,-29,-19,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-10,-24,-21,6,-20,-21,5,-20,6,1,-17,-23,-22,-17,-5,8,13,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-21,-10,-3,-18,-17,-9,-19,13,-17,-9,-2,-15,3,27,3,7,-9,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-24,-20,-29,-23,11,-30,-11,18,-23,12,9,-19,-25,-22,-19,-14,-4,19,-20,4,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-3,-21,-9,-5,-10,-16,-2,-15,5,-14,-3,2,-15,0,4,0,2,-12,-21,-3,-3;
MA   /M: SY='V'; M=9,-17,-11,-22,-17,-9,-18,-21,10,-19,0,0,-13,-19,-15,-20,4,2,13,-28,-12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-19,-29,-20,2,-25,-16,19,-21,30,26,-23,-24,-14,-17,-20,-8,12,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='V'; M=13,-20,-16,-24,-22,-12,-1,-25,5,-18,-2,-1,-17,-21,-21,-21,-4,-5,16,-24,-16,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-28,-2,9,-33,-8,6,-18,4,-18,2,5,-13,39,4,-1,-10,-26,-22,-12,24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-28,-3,15,-35,-21,5,-14,6,-16,1,-4,-12,48,6,-1,-9,-20,-22,-10,32;
MA   /M: SY='V'; M=6,-17,1,-22,-20,-9,-21,-24,7,-18,-4,-2,-14,-21,-18,-19,4,9,18,-31,-14,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=9,0,7,-8,-11,-18,-15,-18,-11,-13,-12,-12,-1,-17,-12,-17,5,9,-4,-31,-17,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-18,-28,-24,-3,-30,-27,25,-21,10,8,-23,-16,-23,-21,-10,2,30,-27,-8,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-17,-13,-9,-12,-21,-5,-4,-13,-5,-3,-3,-14,-3,-11,8,21,-2,-28,-6,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-23,-12,-7,-7,-21,-5,-8,6,-12,-2,-7,-17,-1,3,-2,2,-6,-13,10,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-27,-11,-2,-19,-19,-5,-15,5,-13,-4,-9,7,-1,9,-7,-7,-13,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-15,-27,-23,4,-27,-26,16,-20,7,5,-22,-19,-24,-19,-7,4,25,-24,-6,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-28,-1,8,-25,-14,-6,-23,4,-26,-17,-1,19,1,4,4,-3,-22,-31,-19,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-13,-25,-13,-3,-16,-22,-12,-3,-3,-4,-1,-9,-6,3,-2,-7,-6,-5,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,11,-20,7,1,-20,-5,-3,-17,-7,-19,-13,14,-13,-3,-9,10,6,-15,-33,-15,-1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=40,10160;
NR   /TOTAL=27(27); /POSITIVE=27(27); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=3;
CC   /TAXO-RANGE=????V;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /GENERATED_BY="pfmake blosum45.cmp";
CC   /AUTHOR=S_Spirin;
DR   P20894,           , ; P35946,           , ; RRPL_PHO,           , ;
DR   RRPL_HRS, P         , ;
DR   P52639, RRPL_BDV  , T; P24658, RRPL_CDVO , T; Q66802, RRPL_EBOSM, T;
DR   Q05318, RRPL_EBOZM, T; P28887, RRPL_HRSVA, T; P31352, RRPL_MABVM, T;
DR   P35262, RRPL_MABVP, T; P35975, RRPL_MEASA, T; P12576, RRPL_MEASE, T;
DR   P30929, RRPL_MUMPM, T; P11205, RRPL_NDVB , T; P26676, RRPL_PI2HT, T;
DR   P12577, RRPL_PI3H4, T; P11213, RRPL_RABVP, T; P16289, RRPL_RABVS, T;
DR   P41357, RRPL_RINDR, T; P27566, RRPL_SEND5, T; P06829, RRPL_SENDE, T;
DR   Q06996, RRPL_SENDF, T; P06447, RRPL_SENDZ, T; P35341, RRPL_SV41 , T;
DR   Q88434, RRPL_SV5  , T; Q03396, RRPL_SV5WR, T; P31332, RRPL_SYNV , T;
DR   P13615, RRPL_VSVJH, T; P16379, RRPL_VSVJO, T; P03523, RRPL_VSVSJ, T;
DR   P13179, RRPL_CHAV , P;
DO   <A HREF="http://www.isrec.isb-sib.ch/cgi-bin/get_qdoc?QDOC50520">QDOC50520</A>;
CC   Alignment not available</A>
//
</pre>