ID   RDRP_VIRAL; MATRIX.
AC   PS50521;
DT   JUN-2002 (CREATED); JUN-2002 (DATA UPDATE); JUN-2002 (INFO UPDATE).
DE   Profile for RNA-directed RNA polymerase of double-strand RNA and positive-strand RNA viruses.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=117;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7803; R2=0.01384064; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=124; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-7,-2,-26,-2,-2,-20,-5,-8,-22,-1,-21,-14,0,-1,-4,-2,-2,-5,-19,-21,-13,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-18,-15,-11,-4,-22,-8,0,-11,-1,1,-10,-18,-11,-11,-10,-5,0,-18,0,-12;
MA   /M: SY='L'; M=0,-18,-9,-23,-18,2,-19,-14,2,-18,5,1,-15,-23,-17,-17,-9,-5,4,-18,-2,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-16,-26,-21,6,-23,-17,12,-19,9,7,-17,-24,-18,-18,-12,-5,10,-15,3,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-13,0,5,-20,-2,-11,-22,-8,-18,-15,0,-11,-5,-11,6,0,-16,-28,-17,0;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-16,-16,-22,-18,-2,-18,-19,6,-19,3,2,-12,-21,-16,-18,-7,0,5,-15,-4,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,99,0,-40,-10,-10,-40,-10,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-19,-26,-21,18,-22,-8,4,-18,5,3,-20,-26,-19,-17,-15,-7,3,2,25,-21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-14,-2,1,-20,-5,-12,-19,-6,-26,-18,5,-4,-1,-8,28,18,-11,-35,-19,-1;
MA   /M: SY='K'; M=3,0,-21,-2,3,-26,-3,-8,-25,9,-23,-13,3,-13,5,9,3,-5,-18,-25,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-11,-34,-26,43,-26,-14,-5,-23,1,-1,-21,-29,-28,-18,-19,-12,-6,17,24,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,64,0,-38,-8,-10,-38,-10,-30,-29,20,-10,0,-10,50,0,-29,-40,-20,9;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-21,8,-1,-23,-4,-9,-21,1,-21,-12,0,-12,5,-1,9,9,-15,-21,-14,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-14,-5,-4,-16,-6,0,-18,-10,-21,-12,5,-13,-2,-8,21,13,-11,-33,-12,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-21,-22,-12,-5,-26,-10,8,-14,5,9,-16,-21,0,-12,-12,-7,5,-18,-2,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-20,3,-1,-21,-9,-4,-20,-8,-22,-15,5,0,-2,-9,10,7,-17,-31,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-27,-5,-1,-19,-11,-8,-15,-5,-15,-11,-4,2,-5,-8,-4,-6,-15,-21,-13,-4;
MA   /M: M=-3,-10,-20,-12,-4,-5,-19,-11,-10,-8,-6,-5,-10,-18,-5,-8,-7,-6,-9,-7,-2,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-14,-21,-18,-12,-4,-22,-10,5,-16,7,6,-13,-18,-10,-15,-10,-5,3,-19,-4,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-19,-25,-17,6,-26,-14,8,-14,12,9,-18,-22,-13,-8,-15,-6,7,-18,0,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-25,-2,3,-17,-15,-6,-16,1,-13,-8,-1,-16,2,2,-6,-8,-15,-16,-9,2;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-15,-18,-19,-14,4,-21,-15,1,-15,4,1,-13,-20,-15,-12,-8,-3,2,-17,-3,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-9,-22,-9,3,-11,-18,-9,-3,-9,-2,-1,-10,-15,-3,-11,-4,-4,-3,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-15,-17,-18,-10,-5,-19,-6,-2,-10,1,3,-11,-19,-9,-7,-9,-7,-2,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-23,1,8,-18,-17,-6,-14,-3,-11,-7,-2,-7,1,-6,-2,-3,-14,-25,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-22,-24,-16,-2,-24,-21,14,-17,9,8,-17,-16,-16,-17,-14,-8,10,-22,-6,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-22,-22,-15,0,-21,-7,4,-12,10,9,-16,-23,-10,-5,-15,-8,2,-14,5,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-22,-12,-6,-10,-16,-12,-9,0,-8,-5,-5,-17,-5,1,-7,-5,-7,-17,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-26,-5,1,-11,-17,5,-17,4,-12,-6,-4,-17,1,8,-7,-8,-14,-17,3,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-15,-21,-14,7,-23,-12,-1,-15,8,4,-15,-23,-15,-10,-15,-8,-2,-14,2,-14;
MA   /M: M=-2,-13,-18,-16,-14,-6,0,-8,-11,-15,-7,-4,-9,-20,-13,-14,-4,-6,-8,-17,-2,-14;
MA   /M: M=-7,-11,-22,-13,-10,-5,-12,-13,-5,-14,-1,-1,-9,-15,-11,-13,-9,-7,-5,-20,-8,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-26,2,3,-21,-7,-4,-22,-3,-18,-13,0,0,-2,-5,-2,-6,-20,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-18,4,6,-20,-16,-3,-21,-4,-18,-13,-1,-2,-1,-6,-2,-6,-19,-26,-11,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-19,0,4,-17,-17,-4,-17,-6,-13,-10,-3,-11,-2,-7,-5,-6,-16,-19,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-23,-14,-6,-7,-21,-8,-4,-8,1,1,-11,-18,-4,-3,-9,-5,-4,-18,-5,-6;
MA   /M: M=-2,-10,-20,-12,-7,-11,-13,-10,-5,-11,-4,-4,-7,-17,-7,-9,-2,-2,-4,-23,-9,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-23,2,3,-17,-13,-5,-18,-2,-14,-10,-1,-12,-1,-3,0,-2,-14,-22,-9,0;
MA   /M: M=-7,-9,-23,-10,-5,-8,-19,-10,-8,-5,-5,-4,-8,-15,-4,-2,-7,-5,-8,-15,-3,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-14,-25,-15,-11,-3,-15,-8,-7,-10,-4,-3,-12,-18,-9,-7,-12,-8,-8,-1,6,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-21,-16,-9,-1,-21,-12,-1,-11,2,1,-11,-18,-10,-7,-10,-6,-1,-19,-3,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-21,-12,-8,-1,-19,-5,-7,-7,-2,-2,-8,-20,-8,-3,-8,-4,-6,-18,1,-8;
MA   /M: M=-6,-6,-22,-10,-7,-8,-13,-8,-9,-8,-6,-4,-3,-16,-6,-6,-6,-4,-10,-16,-4,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-11,-19,-13,-9,-9,-18,-5,-7,-6,-1,1,-10,-19,-5,-4,-9,-4,-6,-22,-3,-8;
MA   /M: M=-5,-9,-19,-11,-8,-10,-14,-11,-10,-8,-6,-5,-7,-15,-8,-7,-5,-2,-8,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-20,-4,-4,-13,-15,1,-11,-5,-10,-5,4,-17,-3,-4,0,1,-10,-26,-6,-4;
MA   /M: M=-5,-7,-21,-9,-3,-11,-19,-5,-6,-8,-6,-3,-4,-12,-4,-8,-2,-1,-7,-23,-5,-5;
MA   /M: M=-7,-11,-14,-14,-11,-8,-16,-11,-5,-10,-5,-3,-8,-19,-11,-9,-7,-5,-4,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-16,-18,-13,-7,-18,-15,0,-12,-3,1,-12,-18,-11,-12,-6,-1,2,-18,-6,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-4,-21,-7,-4,-12,-13,-5,-13,-2,-14,-7,0,-16,0,-2,1,-1,-10,-21,-5,-2;
MA   /M: M=-5,-3,-21,-2,-5,-10,-13,-11,-9,-10,-6,-7,-5,-16,-9,-9,-3,-1,-5,-25,-8,-8;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4;
MA   /M: M=-5,-13,-17,-15,-12,-8,-9,-12,-6,-11,-4,-3,-11,-15,-11,-10,-7,-6,-4,-19,-6,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-3,-6,-20,-7,-5,-13,-10,-9,-11,-6,-12,-7,-3,-8,-6,-8,-2,-2,-10,-19,-8,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-1,-6,-18,-8,-5,-10,-9,-12,-8,-10,-5,-6,-4,-14,-9,-11,-2,-2,-6,-23,-10,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-2,-7,-14,-9,-9,-12,-8,-13,-10,-8,-9,-5,-6,-15,-9,-8,-4,-4,-6,-21,-11,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-4,-11,-18,-13,-10,-11,-11,-16,-3,-10,-5,-2,-10,-13,-10,-11,-6,-5,-1,-22,-11,-11; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-18,-10,-9,-8,-12,-7,-3,-8,-2,4,-8,-16,-7,-7,-7,-6,-2,-19,-4,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-4,-8,-17,-10,-9,-10,-6,-12,-11,-7,-9,-6,-6,-13,-9,-4,-3,-4,-7,-19,-10,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-5,-9,-18,-11,-8,-5,-12,-6,-7,-6,-6,-4,-6,-16,-6,-3,-4,-2,-4,-16,-1,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-5,-11,-17,-14,-12,-4,-10,-11,-3,-10,-4,-3,-8,-18,-11,-9,-5,0,-1,-11,0,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-6,-8,-17,-8,-5,-13,-4,-9,-11,-5,-8,-6,-6,-15,-5,-2,-5,-6,-8,-16,-8,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,-15,-10,-9,0,-12,-8,-2,-6,-3,-1,-7,-11,-8,-6,-6,-4,-1,-11,2,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-5,-3,-15,-4,-2,-7,-5,-5,-7,-3,-7,-4,-2,-9,-2,-3,-4,-4,-7,-6,-1,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-4; MD=-4; IM=-4; DM=-4;
MA   /M: M=-4,-2,-9,-3,-3,-6,-5,-2,-9,-3,-8,-5,-1,-8,-3,-4,-2,-4,-7,-11,-4,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-17,-12,-9,-20,16,-14,-21,-12,-17,-9,-5,-18,-7,-13,-1,-6,-15,-23,-17,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-22,-15,-10,-6,-17,-5,-6,-4,-2,3,-6,-19,-4,6,-7,-3,-5,-22,-4,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-24,-10,-5,-18,-12,-12,-16,-4,-17,-7,-7,14,-5,-6,-2,-2,-16,-25,-16,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-11,-3,-3,-17,-4,-11,-16,-10,-24,0,7,-11,-1,-10,33,22,-7,-37,-17,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-12,-20,-24,64,-19,-37,-20,-28,-19,-1,-21,-21,-20,-1,-19,-28,-18,-25,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-18,14,10,-21,-15,0,-21,-3,-17,-12,7,-14,4,-5,1,-6,-18,-31,-13,7;
MA   /M: SY='P'; M=3,-13,-23,-15,-11,-10,-6,-16,-12,-12,-12,-8,-10,5,-13,-15,-4,-6,-11,-19,-12,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-2,0,-13,-6,-10,-5,-9,-11,-12,-13,-11,-10,4,-18,-11,-13,3,3,-10,-22,-8,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-11,-11,-10,-20,-20,-8,-10,-9,-9,-1,-10,-10,-10,19,48,1,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='S'; M=1,-10,-16,-12,-9,0,-15,-13,-6,-12,-7,-7,-7,-18,-10,-12,6,6,-1,-21,-2,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-17,-18,-19,-14,1,-23,-17,8,-18,8,4,-15,-20,-15,-18,-10,-4,7,-21,-2,-15;
MA   /M: M=-2,-8,-21,-11,-12,-9,-2,-10,-10,-14,-7,-4,-4,-19,-11,-13,-4,-7,-8,-20,-10,-12;
MA   /M: SY='N'; M=10,28,-22,10,10,-20,10,12,0,-10,0,0,43,-19,1,-10,-10,-10,-26,-36,-16,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-4,-7,-6,-15,-11,-15,-15,9,-19,-14,3,-13,-6,-10,24,27,-5,-34,-15,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-22,-28,-21,7,-29,-18,20,-21,19,16,-21,-24,-18,-17,-18,-7,15,-17,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-14,-24,-20,4,-26,-14,9,-20,9,6,-15,-23,-16,-16,-12,-3,8,-17,1,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-18,-3,-8,-8,-10,5,-11,-7,-11,-4,21,-21,-6,-4,-1,-2,-15,-28,-8,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-15,-11,-21,-14,-7,-20,-14,3,-14,2,5,-12,-22,-10,-13,-9,-5,2,-15,-5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=6,-19,-14,-25,-17,-5,-18,-20,6,-16,5,4,-15,-19,-14,-16,-8,-4,6,-19,-8,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-18,-26,-18,3,-26,-11,13,-18,14,14,-18,-23,-11,-16,-16,-7,7,-16,5,-16;
MA   /M: SY='I'; M=2,-16,-19,-22,-17,-5,-17,-15,6,-16,3,6,-14,-19,-12,-16,-6,1,6,-18,-4,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-21,-12,-6,-8,-20,-4,-8,-3,-4,-2,-7,-19,-3,4,-6,-2,-6,-19,-1,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-12,-16,-15,-12,-4,-14,-6,-6,-12,-6,-4,-9,-18,-10,-12,-2,0,-4,-16,5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-11,-19,-14,-7,-16,-16,0,-14,0,0,-12,-19,-13,-14,-5,-4,4,-23,-9,-14;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-15,-15,-19,-14,1,-16,-11,-3,-14,2,1,-13,-23,-10,-12,-13,-8,-5,-9,4,-13; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-21,-4,1,-13,-17,-9,-9,-2,-5,-4,-6,-12,-2,-1,-6,-5,-8,-21,-7,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-18,-6,1,-13,-17,-3,-11,2,-7,-3,-6,-16,0,2,-7,-6,-8,-21,-6,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-11,-15,-14,-9,-8,-18,-9,-2,-9,1,0,-10,-17,-8,-7,-7,-3,0,-20,-6,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-16,-6,-7,-11,1,-10,-15,-8,-11,-8,-3,-16,-8,-8,-1,-3,-11,-19,-8,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-4,-9,-19,-11,-7,-10,-10,-10,-6,-7,-4,-2,-6,-10,-6,-6,-5,-5,-5,-21,-9,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,3,-19,5,5,-17,-8,-7,-16,2,-15,-11,2,-6,0,2,1,-2,-12,-23,-13,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-5,-7,-14,-8,-6,-8,-11,-2,-5,-7,-7,-4,-3,-7,-4,-6,-3,-4,-5,-15,-4,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-15,0,1,-9,-6,-3,-9,-3,-8,-6,0,-3,-2,-5,-1,-2,-9,-13,-4,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-4,-3,-12,-3,-4,-4,-4,-6,-7,-4,-5,-5,-1,-11,-5,-3,-2,-3,-5,-12,-5,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,0,-13,1,0,-10,-8,-5,-7,-3,-8,-6,0,0,-2,-4,1,-1,-6,-16,-8,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-4,-3,-9,-3,-3,-5,-8,-4,-6,-4,-4,-2,-3,-8,-3,-3,-3,-3,-5,-10,-4,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-16,-16,-12,-2,-20,-14,-2,-13,-3,-3,-13,-16,-13,-12,-6,-3,2,-19,-5,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-17,-8,-5,-13,-14,-10,-16,-2,-15,-10,-3,-13,-5,1,0,-1,-12,-19,-9,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-20,-14,-25,-17,2,-23,-16,10,-19,11,12,-18,-21,-13,-18,-14,-8,7,-19,-1,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-17,-14,-22,-15,-4,-21,-13,5,-13,4,7,-13,-21,-9,-11,-8,-4,4,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-4,-23,-21,6,-24,-17,6,-18,-1,-1,-11,-25,-20,-18,-6,-1,10,-21,0,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-8,-17,-12,-12,-1,-17,-3,-5,-9,-4,-2,-5,-22,-7,-9,-6,-5,-6,-13,12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,-10,-19,-18,-19,60,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,99,0,-40,-10,-10,-40,-10,-30,-30,0,-10,-10,-10,-10,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,99,0,-40,-10,-10,-40,-10,-30,-30,0,-10,-10,-10,-10,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-7,-5,-13,-12,-14,-8,-15,-7,-14,-9,-5,-1,-20,-11,-14,3,1,-3,-31,-16,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-14,-31,-25,6,-31,-23,23,-23,21,13,-25,-27,-22,-20,-19,-7,22,-21,0,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-18,-27,-18,3,-27,-21,16,-19,13,9,-21,-22,-17,-18,-14,-6,15,-18,-2,-19;
MA   /M: M=0,-11,-13,-14,-14,-8,-12,-15,-4,-15,-8,-5,-6,-15,-13,-14,0,-2,-2,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-16,-11,-20,-16,0,-19,-15,-2,-15,-4,-4,-12,-19,-14,-14,-3,2,1,-15,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-22,5,8,-22,-14,-4,-20,2,-20,-14,5,-4,2,-1,1,-4,-18,-29,-15,4;
MA   /M: M=-7,-6,-20,-6,-3,-15,-13,-8,-16,-3,-14,-9,-4,-4,-5,-3,-5,-6,-14,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-22,2,6,-24,-7,-8,-21,0,-19,-13,-1,-5,1,-4,1,-5,-17,-28,-17,3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=40,10160;
NR   /TOTAL=265(265); /POSITIVE=265(265); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=21;
CC   /TAXO-RANGE=?B??V;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /GENERATED_BY=manual correction of "pfmake blosum45.cmp" output;
CC   /AUTHOR=S_Spirin;
DR   P21231, POLG_SBMVN  T, ;
DR   P05080, 194K_TRVSY, T; Q04574, POL1_BAYMG, T; Q01206, POL1_BAYMJ, T;
DR   P13025, POL1_GCMV , T; P29149, POL1_GFLV , T; P18522, POL1_TBRVS, T;
DR   Q65399, POLG_BCMVN, T; P12915, POLG_BOVEV, T; Q65730, POLG_BSTV1, T;
DR   Q65729, POLG_BSTVG, T; P19711, POLG_BVDVN, T; Q01499, POLG_BVDVS, T;
DR   Q65900, POLG_CXA16, T; P22055, POLG_CXA21, T; P36290, POLG_CXA24, T;
DR   P21404, POLG_CXA9 , T; P08291, POLG_CXB1J, T; P03313, POLG_CXB3N, T;
DR   Q66282, POLG_CXB3W, T; Q86887, POLG_CXB4E, T; P08292, POLG_CXB4J, T;
DR   Q03053, POLG_CXB5P, T; P33478, POLG_DEN1S, T; P29990, POLG_DEN26, T;
DR   P29991, POLG_DEN27, T; P07564, POLG_DEN2J, T; P14340, POLG_DEN2N, T;
DR   P12823, POLG_DEN2P, T; P27915, POLG_DEN3 , T; P09866, POLG_DEN4 , T;
DR   O91734, POLG_EC01F, T; Q9YLJ1, POLG_EC05N, T; Q66474, POLG_EC06C, T;
DR   Q66577, POLG_EC09B, T; Q66849, POLG_EC09H, T; P29813, POLG_EC11G, T;
DR   Q66575, POLG_EC12T, T; Q66578, POLG_EC22H, T; Q9YID8, POLG_EC23C, T;
DR   O73556, POLG_EC23W, T; Q9WN78, POLG_EC30B, T; P03304, POLG_EMCV , T;
DR   P17593, POLG_EMCVB, T; P17594, POLG_EMCVD, T; P03306, POLG_FMDV1, T;
DR   P03308, POLG_FMDVA, T; P03305, POLG_FMDVO, T; P03311, POLG_FMDVS, T;
DR   P49303, POLG_FMDVZ, T; P26664, POLG_HCV1 , T; P19712, POLG_HCVA , T;
DR   P21530, POLG_HCVB , T; P26663, POLG_HCVBK, T; P27958, POLG_HCVH , T;
DR   P26660, POLG_HCVJ6, T; P26661, POLG_HCVJ8, T; P26662, POLG_HCVJA, T;
DR   Q00269, POLG_HCVJT, T; P29846, POLG_HCVTW, T; P32537, POLG_HE701, T;
DR   Q66478, POLG_HE71B, T; Q66479, POLG_HE71M, T; P26580, POLG_HPAV2, T;
DR   P26581, POLG_HPAV4, T; P26582, POLG_HPAV8, T; P08617, POLG_HPAVH, T;
DR   P06441, POLG_HPAVL, T; P13901, POLG_HPAVM, T; P14553, POLG_HPAVS, T;
DR   P03303, POLG_HRV14, T; Q82122, POLG_HRV16, T; P12916, POLG_HRV1B, T;
DR   P04936, POLG_HRV2 , T; P07210, POLG_HRV89, T; P27395, POLG_JAEV1, T;
DR   P19110, POLG_JAEV5, T; P32886, POLG_JAEVJ, T; P14335, POLG_KUNJM, T;
DR   P29837, POLG_LANVT, T; P31999, POLG_LMV0 , T; P89876, POLG_LMVE , T;
DR   P33515, POLG_MCFA , T; P20234, POLG_OMV  , T; Q01500, POLG_PEMVC, T;
DR   O56075, POLG_PEMVM, T; O41174, POLG_PEV9U, T; P03299, POLG_POL1M, T;
DR   P03301, POLG_POL1S, T; P06210, POLG_POL2L, T; P23069, POLG_POL2W, T;
DR   P06209, POLG_POL32, T; P03302, POLG_POL3L, T; Q04538, POLG_POWVL, T;
DR   P13529, POLG_PPVD , T; Q01681, POLG_PPVEA, T; P17766, POLG_PPVNA, T;
DR   P17767, POLG_PPVRA, T; Q84934, POLG_PPVSK, T; Q01901, POLG_PRSVH, T;
DR   P19723, POLG_PRSVP, T; P19724, POLG_PRSVW, T; P29152, POLG_PSBMV, T;
DR   Q02963, POLG_PVYHU, T; P18247, POLG_PVYN , T; Q05057, POLG_PYFV1, T;
DR   Q90069, POLG_SBMVG, T; P16604, POLG_SVDVH, T; P13900, POLG_SVDVU, T;
DR   Q01299, POLG_TBEVH, T; P07720, POLG_TBEVS, T; P14336, POLG_TBEVW, T;
DR   P04517, POLG_TEV  , T; P08544, POLG_TMEVB, T; P13899, POLG_TMEVD, T;
DR   P08545, POLG_TMEVG, T; P89509, POLG_TUMVJ, T; Q02597, POLG_TUMVQ, T;
DR   P09814, POLG_TVMV , T; P18478, POLG_WMV2U, T; P06935, POLG_WNV  , T;
DR   P03314, POLG_YEFV1, T; P19901, POLG_YEFV2, T; P18479, POLG_ZYMVC, T;
DR   Q89330, POLG_ZYMVR, T; O36979, POLG_ZYMVS, T; P03300, POLH_POL1M, T;
DR   P36327, POLN_EEVV3, T; P36328, POLN_EEVVP, T; P27282, POLN_EEVVT, T;
DR   P27407, POLN_FCVC6, T; P27408, POLN_FCVF4, T; P27409, POLN_FCVF9, T;
DR   P29324, POLN_HEVBU, T; Q03495, POLN_HEVME, T; Q04610, POLN_HEVMY, T;
DR   P33424, POLN_HEVPA, T; P54634, POLN_LORDV, T; Q69014, POLN_MANCV, T;
DR   P03318, POLN_MIDDV, T; P13886, POLN_ONNVG, T; P27410, POLN_RHDV , T;
DR   P13887, POLN_RRVN , T; P13888, POLN_RRVT , T; P13889, POLN_RUBVT, T;
DR   P08411, POLN_SFV  , T; P27283, POLN_SINDO, T; P03317, POLN_SINDV, T;
DR   P36286, POLN_SMSV1, T; Q04544, POLN_SOUV3, T; P36309, POLR_ASGVP, T;
DR   P35928, POLR_ELV  , T; P20126, POLR_EPMV , T; P36304, POLR_KYMVJ, T;
DR   P20127, POLR_OYMV , T; P10358, POLR_TYMV , T; P20128, POLR_TYMVA, T;
DR   P28477, POLR_TYMVC, T; P19811, RPOA_EAV  , T; Q04561, RPOA_LELV , T;
DR   P18458, RRPB_BEV  , T; P16342, RRPB_CVMA5, T; P29982, RRPB_CVMJH, T;
DR   P26314, RRPB_IBVB , T; O70695, RRPL_AHSV9, T; P13840, RRPL_BTV10, T;
DR   Q02119, RRPL_RDVA , T; Q98631, RRPL_RDVF , T; P54891, RRPO_ACLSA, T;
DR   P27738, RRPO_ACLSP, T; Q9DIC5, RRPO_AHNNV, T; Q96631, RRPO_BBV  , T;
DR   Q992J0, RRPO_BOOLV, T; P15965, RRPO_BPFR , T; P07393, RRPO_BPGA , T;
DR   P00585, RRPO_BPMS2, T; P14647, RRPO_BPQBE, T; P09675, RRPO_BPSP , T;
DR   P09507, RRPO_BWYVF, T; P29044, RRPO_BYDV1, T; P09505, RRPO_BYDVP, T;
DR   P29045, RRPO_BYDVR, T; P04518, RRPO_CARMV, T; P19523, RRPO_CGMVS, T;
DR   P15187, RRPO_CNV  , T; Q66220, RRPO_CRMV , T; P17459, RRPO_CRV  , T;
DR   P37987, RRPO_CVB  , T; Q66929, RRPO_FHV  , T; P22168, RRPO_FXMV , T;
DR   Q993M1, RRPO_GGNNV, T; P11640, RRPO_MCMV , T; P15095, RRPO_NMV  , T;
DR   Q9IMM4, RRPO_NODAV, T; P89659, RRPO_ORSVC, T; Q84133, RRPO_ORSVS, T;
DR   Q07518, RRPO_P1AMV, T; Q9J7Z2, RRPO_PAV  , T; P29154, RRPO_PEAMV, T;
DR   P17520, RRPO_PLRV1, T; P11623, RRPO_PLRVW, T; P89657, RRPO_PMMVJ, T;
DR   P29098, RRPO_PMMVS, T; P20951, RRPO_PMV  , T; P17965, RRPO_PVMR , T;
DR   P22657, RRPO_PVSP , T; P09395, RRPO_PVX  , T; P22591, RRPO_PVXCP, T;
DR   Q07630, RRPO_PVXHB, T; P17779, RRPO_PVXX3, T; P22956, RRPO_RCNMV, T;
DR   P17468, RRPO_ROTBR, T; P21615, RRPO_ROTBU, T; P35942, RRPO_ROTGI, T;
DR   P26190, RRPO_ROTPC, T; P17699, RRPO_ROTPG, T; P22678, RRPO_ROTS1, T;
DR   P21405, RRPO_SBMV , T; P89202, RRPO_SHMV , T; Q04575, RRPO_SHVX , T;
DR   Q9QAZ8, RRPO_SJNNV, T; P28897, RRPO_SMYEA, T; P15962, RRPO_TBSVC, T;
DR   P17460, RRPO_TCV  , T; P18339, RRPO_TMGMV, T; P90211, RRPO_TMOB , T;
DR   P03586, RRPO_TMV  , T; Q9YQ08, RRPO_TMVB , T; P30738, RRPO_TMVKR, T;
DR   O93058, RRPO_TMVOM, T; Q98745, RRPO_TMVRA, T; P22958, RRPO_TNVA , T;
DR   P27209, RRPO_TNVD , T; Q9Q1T8, RRPO_TOMK1, T; P89676, RRPO_TOMK2, T;
DR   P03587, RRPO_TOML , T; Q9YKD6, RRPO_TOMS1, T; Q88920, RRPO_TVCV , T;
DR   P09498, RRPO_WCMVM, T; P15402, RRPO_WCMVO, T; P27462, V2A_BBMV  , T;
DR   P03594, V2A_BMV   , T; P20179, V2A_CCMV  , T; O39436, V2A_CMVAS , T;
DR   Q66136, V2A_CMVB  , T; P16490, V2A_CMVFN , T; Q83262, V2A_CMVII , T;
DR   Q66117, V2A_CMVIX , T; Q86783, V2A_CMVK  , T; Q96711, V2A_CMVKO , T;
DR   Q66145, V2A_CMVMB , T; O40977, V2A_CMVNT , T; P06012, V2A_CMVQ  , T;
DR   Q83265, V2A_CMVY  , T; P28727, V2A_PSVJ  , T; P29035, V2A_TAV   , T;
DR   P03593, V90K_AMVLE, T; Q02941, VGNB_APMV , T; P03600, VGNB_CPMV , T;
DR   P36312, VGNB_CPSMV, T; P35930, VGNB_RCMV , T; P17378, VL3_REOVD , T;
DR   P17377, VL3_REOVJ , T; P17376, VL3_REOVL , T; P11124, VP2_BPPH6 , T;
DR   P22556, COAT_TAMV , P; Q65729, POLG_BYMV , P; P13418, POLG_CRPV , P;
DR   P20177, POLG_CYVV , P; P32652, POLG_MDMV , P; P21294, POLG_PVYCH, P;
DR   P11897, POLG_PVYYO, P; P25242, POLG_SUMVS, P; Q89251, POLG_WMV2T, P;
DR   P20235, POLH_WMV2A, P; P36287, POLN_SMSV4, P; P36697, RRPB_CVCAI, P;
DR   P18457, RRPB_CVPFS, P; Q04158, RRPB_CVPR8, P; P12723, RRPB_IBVK , P;
DR   P09674, RRPO_BPBZ1, P; P34701, RRPO_BPJP3, P; P31817, RRPO_IBDV5, P;
DR   P27328, RRPO_LSV  , P; P27327, RRPO_LVX  , P; P23172, RRPO_SCVLA, P;
3D   1C2P; 1CSJ; 1HHS; 1HHT; 1HI0; 1HI1; 1HI8; 1KHV; 1KHW; 1QUV;
3D   1QX5; 1QX6; 1RDR;
DO   QDOC50520;
CC   Alignment not available
//